Informatički odjel Muzeja grada Zagreba utemeljen je 1999. godine kad je Muzej zaposlio prvu muzejsku informatičarku dr. sc. Maju Šojat-Bikić. U skladu s razvojem informacijskih tehnologija u društvu općenito, bilo je potrebno osuvremeniti i muzejsku djelatnost, uvesti Muzej u 21. stoljeće. Od samih početaka rad Odjela podrazumijevao je produkcija različitih digitalnih pomagala i sadržaja, a to su: baze podataka; digitalizaciju različite građe i sadržaja te stvaranje internih digitalnih zbirka; kreiranje različitih multimedijskih sadržaja i zvučnih kulisa za potrebe izložba; rad na referentnim proizvodima, kao što su CD i DVD-ROM-ovi; kreiranje sadržaja i uređivanje i održavanje mrežnih stranica Muzeja.
Neki od ranijih projekata informatičkog odjela: baza podataka izložbi i izdanja; bibliografska baza priloga o MGZ-u s bibliometrijskim modulom (dugogodišnji projekt, zaključen 2017.); digitalna zbirka izdanja, publiciranih radova djelatnika MGZ-a i članaka o aktivnostima MGZ-a u PDF formatu (dugogodišnji projekt, zaključen 2017.); CD i DVD izdanja kao što su: Zvonimir Faist: Diktati vremena – Plakati od kasnih 1930-ih do ranih 1960-ih godina, 2004., DVD-ROM; Ilustrirana tonfilmska revija Svijet: Zagreb 1926.-1936., 2007. DVD-ROM; Glazba iz kutije: izbor iz glazbenog repertoara mehaničkih automata Ivana Gerersdorfera, 2010. CD-ROM itd.
Osim tekućih poslova Odjela na održavanju muzejske informatičke opreme te uređivanju mrežnih stranica, danas je primarna i najvažnija djelatnost donošenje idejnih rješenja i produkcija multimedijalnih digitalnih sadržaja za prezentaciju sadržaja i muzejske građe na povremenim izložbama, u okviru osuvremenjivanja stalnog postava Muzeja, događanjima i dr.